Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
RPS29P62273 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
RPS29P62273 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
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