Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP107P57740 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUP107P57740 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUP107P57740 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUP107P57740 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms