Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTBP2P56545 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms