Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms