Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms