Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFSF9P41273 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms