Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBL1P28749 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms