Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms