Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms