Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms