Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DESP17661 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DESP17661 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms