Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAV1P15498 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms