Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD8P13378 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms