Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSLP07711 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms