Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms