Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms