Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms