Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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