Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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