Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms