Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA8SH3BPF8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms