Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms