Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms