Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms