Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK1Q9UPV9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms