Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms