Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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