Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD3Q9P035 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms