Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms