Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms