Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms