Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms