Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms