Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms