Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYN7

ZNF341, Zinc finger protein 341, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF341Q9BYN7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF341Q9BYN7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF341Q9BYN7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms