Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms