Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA5Q9BWX5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms