Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms