Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms