Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GORASP1Q9BQQ3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms