Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms