Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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