Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FGD4Q96M96 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms