Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SAMD8Q96LT4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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