Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTV1Q96GA3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTV1Q96GA3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms