Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM12Q96EX1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms