Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NXNL1Q96CM4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms