Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms