Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms