Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRT2Q7Z6L0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms